Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RFTN1Q14699 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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