Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTTNQ14247 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTTNQ14247 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTTNQ14247 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms