Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1CQ13936 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1CQ13936 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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