Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOFQ13790 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOFQ13790 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOFQ13790 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOFQ13790 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms