Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CUL4BQ13620 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CUL4BQ13620 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CUL4BQ13620 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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