Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC1Q13547 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms