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| FOXE3 | Q13461 | VKORC1-202 | ENST00000319788 | 1077 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.01 | □□□□□ -0.01 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HPF1-201 | ENST00000393381 | 1230 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.01 | □□□□□ -0.01 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AQP12B-201 | ENST00000407834 | 1094 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 15.01 | □□□□□ -0.01 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CRYGFP-201 | ENST00000418459 | 633 nt | BASIC | 15.01 | □□□□□ -0.01 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | SMPD3-201 | ENST00000219334 | 5453 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.99 | □□□□□ -0.01 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | LGI2-201 | ENST00000382114 | 6428 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.99 | □□□□□ -0.01 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLC25A39-202 | ENST00000377095 | 1565 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 14.99 | □□□□□ -0.01 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FAM216A-201 | ENST00000377673 | 1582 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.99 | □□□□□ -0.01 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | TLK2-203 | ENST00000346027 | 3449 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 14.99 | □□□□□ -0.01 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HMCES-201 | ENST00000383463 | 2515 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 14.99 | □□□□□ -0.01 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FAM198A-202 | ENST00000430121 | 3121 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 14.99 | □□□□□ -0.01 | | |
| FOXE3 | Q13461 | B4GALT2-201 | ENST00000309519 | 2004 nt | TSL 2 BASIC | 14.99 | □□□□□ -0.01 | | |
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