Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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FOXE3Q13461 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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FOXE3Q13461 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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