Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE3BQ13370 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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