Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP3B2Q13367 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP3B2Q13367 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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