Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MAP3K1Q13233 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAP3K1Q13233 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms