Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPA4Q13156 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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RPA4Q13156 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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RPA4Q13156 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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RPA4Q13156 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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RPA4Q13156 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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RPA4Q13156 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPA4Q13156 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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