Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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