Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LOXL1Q08397 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms