Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DEUP1Q05D60 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms