Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPIBQ01892 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIBQ01892 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms