Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC10Q01780 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC10Q01780 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms