Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CLTCQ00610 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLTCQ00610 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms