Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGD1P98174 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FGD1P98174 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FGD1P98174 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FGD1P98174 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms