Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ERVPABLB-1P60509 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ERVPABLB-1P60509 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms