Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX16P57768 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX16P57768 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX16P57768 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX16P57768 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX16P57768 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX16P57768 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX16P57768 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX16P57768 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms