Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP9P55211 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP9P55211 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CASP9P55211 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms