Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELLP55199 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ELLP55199 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ELLP55199 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELLP55199 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELLP55199 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELLP55199 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ELLP55199 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ELLP55199 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms