Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EFNA4P52798 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms