Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SMARCA2P51531 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA2P51531 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA2P51531 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA2P51531 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA2P51531 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA2P51531 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA2P51531 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA2P51531 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA2P51531 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA2P51531 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA2P51531 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA2P51531 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA2P51531 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SMARCA2P51531 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SMARCA2P51531 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SMARCA2P51531 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms