Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI2P48788 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms