Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TDO2P48775 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TDO2P48775 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TDO2P48775 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TDO2P48775 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDO2P48775 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDO2P48775 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TDO2P48775 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TDO2P48775 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDO2P48775 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDO2P48775 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDO2P48775 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDO2P48775 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDO2P48775 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TDO2P48775 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDO2P48775 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDO2P48775 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDO2P48775 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDO2P48775 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDO2P48775 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDO2P48775 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TDO2P48775 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDO2P48775 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDO2P48775 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDO2P48775 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDO2P48775 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms