Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJA8P48165 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJA8P48165 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJA8P48165 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJA8P48165 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA8P48165 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA8P48165 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA8P48165 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA8P48165 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA8P48165 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA8P48165 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA8P48165 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA8P48165 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA8P48165 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJA8P48165 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms