Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UTRNP46939 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UTRNP46939 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UTRNP46939 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UTRNP46939 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UTRNP46939 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UTRNP46939 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UTRNP46939 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UTRNP46939 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UTRNP46939 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UTRNP46939 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UTRNP46939 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UTRNP46939 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UTRNP46939 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UTRNP46939 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UTRNP46939 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UTRNP46939 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UTRNP46939 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UTRNP46939 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UTRNP46939 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTRNP46939 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms