Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHKA1P46020 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHKA1P46020 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms