Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCAMP43121 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCAMP43121 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCAMP43121 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms