Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GDF5P43026 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GDF5P43026 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GDF5P43026 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GDF5P43026 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GDF5P43026 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GDF5P43026 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GDF5P43026 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GDF5P43026 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDF5P43026 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDF5P43026 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDF5P43026 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDF5P43026 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDF5P43026 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDF5P43026 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GDF5P43026 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDF5P43026 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDF5P43026 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDF5P43026 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms