Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LTBRP36941 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LTBRP36941 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LTBRP36941 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LTBRP36941 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LTBRP36941 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LTBRP36941 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LTBRP36941 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LTBRP36941 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LTBRP36941 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LTBRP36941 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LTBRP36941 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LTBRP36941 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LTBRP36941 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LTBRP36941 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LTBRP36941 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LTBRP36941 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms