Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPC1P35052 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPC1P35052 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPC1P35052 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPC1P35052 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPC1P35052 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPC1P35052 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPC1P35052 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GPC1P35052 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPC1P35052 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPC1P35052 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms