Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DSG3P32926 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSG3P32926 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DSG3P32926 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DSG3P32926 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSG3P32926 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSG3P32926 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG3P32926 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG3P32926 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG3P32926 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG3P32926 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG3P32926 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG3P32926 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG3P32926 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSG3P32926 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms