Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCR5P32302 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCR5P32302 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCR5P32302 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCR5P32302 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCR5P32302 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms