Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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CASQ1P31415 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASQ1P31415 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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