Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CMPK1P30085 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms