Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARID4AP29374 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms