Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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RAB5AP20339 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RAB5AP20339 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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RAB5AP20339 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RAB5AP20339 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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RAB5AP20339 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB5AP20339 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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