Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CXCL3P19876 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms