Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL3L1P16619 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCL3L1P16619 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms