Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM27P14373 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM27P14373 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms