Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL2P13500 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL2P13500 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL2P13500 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL2P13500 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL2P13500 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL2P13500 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCL2P13500 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms