Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDH1P12830 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDH1P12830 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDH1P12830 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDH1P12830 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms