Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD1P0DJD0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms