Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRB1P04280 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRB1P04280 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRB1P04280 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRB1P04280 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRB1P04280 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRB1P04280 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRB1P04280 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRB1P04280 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRB1P04280 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRB1P04280 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRB1P04280 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRB1P04280 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRB1P04280 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRB1P04280 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRB1P04280 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRB1P04280 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRB1P04280 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRB1P04280 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRB1P04280 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRB1P04280 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRB1P04280 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PRB1P04280 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRB1P04280 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRB1P04280 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms