Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBA3O96018 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APBA3O96018 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APBA3O96018 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APBA3O96018 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APBA3O96018 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APBA3O96018 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
APBA3O96018 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms