Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CBX7O95931 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CBX7O95931 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX7O95931 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX7O95931 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX7O95931 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX7O95931 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX7O95931 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CBX7O95931 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CBX7O95931 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CBX7O95931 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBX7O95931 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.9 ms