Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1O95476 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms