Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF3O95398 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF3O95398 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF3O95398 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF3O95398 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF3O95398 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF3O95398 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF3O95398 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF3O95398 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF3O95398 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF3O95398 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF3O95398 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF3O95398 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF3O95398 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF3O95398 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RAPGEF3O95398 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RAPGEF3O95398 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms